Der findes eksempler på fiskeolie, som er trukket tilbage fra markedet på grund af et for højt indhold af tungmetaller. Men generelt kan man sige at der er mere kontrol med fiskeolie på kapsler end med fisk du køber hos fiskehandleren på det punkt, så hvis man køber et anerkendt mærke, så bør det ikke være tungmetaller i den fiskeolie som er i kapslerne.